微生物(microbe,microorganism)非分類學上名詞，來自法語"Microbe"一詞。通常是描述一切不借助顯微鏡用肉眼看不見的微小生物。這類微生物包括病毒、細菌、古菌、真菌、原生動物和某些藻類。

       微生物是指大量的、極其多樣的、不借助顯微鏡看不見的微小生物類群的總稱。因此，微生物通常包括病毒、亞病毒（類病毒、擬病毒、朊病毒）、具原核細胞結構的真細菌、古生菌以及具真核細胞結構的真菌（酵母、霉菌、蕈菌等）、原生動物和單細胞藻類，它們的大小和特征見下表。但是有些例外，如許多真菌的子實體、蘑菇等常肉眼可見；相同的，某些藻類能生長幾米長。一般來說微生物可以認為是相當簡單的生物，大多數的細菌、原生動物、某些藻類和真菌是單細胞的微生物，即使為多細胞的微生物，也沒有許多的細胞類型。病毒甚至沒有細胞，只有蛋白質外殼包圍著的遺傳物質，且不能獨立存活。