土壤細菌是一類單細胞、無完整細胞核的生物。它占土壤微生物總數的70%~90%。個體小，代謝強，繁殖快，是土壤中最活躍的因素。細菌的基本形態有：球狀、桿狀和螺旋狀。土壤中常見的細菌屬有節桿菌屬、芽孢菌屬、產堿桿菌屬、假單胞菌屬、土壤桿菌屬。

       碳水化合物分解細菌——分解糖、淀粉、纖維素等。

       氨化細菌——有機含N化合物中的N素，通過氨化細菌的作用轉化形成氨；微生物分解含氮有機化合物釋放氨的過程稱為氨化過程。

       硝化細菌——氨經硝化細菌作用轉化為亞硝酸，然后轉化為硝酸。微生物氧化銨為硝酸并從中獲得能量的過程稱為硝化過程。

       反硝化細菌——硝態氮在反硝化細菌作用下，使硝酸還原成還原態氮。微生物將硝酸鹽還原為還原態含氮化合物或分子態氮的過程稱為反硝化過程。